基因叔叔：科普、期刊導讀(Uncle Gene)

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不但給你最強基因科普，還免費送你期刊導讀；救人一命勝造七級浮屠，想知道就在基因叔叔。真是好詩，好詩！ EGFR,KRAS,NRAS,HRAS,TET2,JAK2,P53,DNMT3A,PIK3CA,MED12,BRAF,PI3K,KIT,FLT3,ASXL1,BRCA-1,BRCA-2,ABL,AKT3,SNP,breast cancer,colorectal cancer,gastric cancer,Liver cancer,Lung cancer,Leukemia cancer,Ovary cancer,Prostate cancer,femtopath,genonfire,oncogene,prevention,drugs,information for genes,OIS,screening,journal, Association between Tumor Epidermal Growth Factor Receptor Mutation and Pulmonary Tuberculosis in Patients with Adenocarcinoma of the Lungs Epidermal growth factor receptor (EGFR) in lung cancer: an overview and update Targeting the EGFR Pathway for Cancer Therapy EGFR mutation testing in lung cancer: a review of available methods and their use for analysis of tumour tissue and cytology samples Epidermal Growth Factor Receptor in Pancreatic Cancer Targeting the Raf-MEK-ERK mitogen-activated protein kinase cascade for the treatment of cancer PIK3CA Mutations Frequently Coexist with EGFR/KRAS Mutations in Non-Small Cell Lung Cancer and Suggest Poor Prognosis in EGFR/KRAS Wildtype Subgroup Lei Wang1,2., Haichuan Hu1,2., Yunjian Pan1,2., Rui Wang1,2, Yuan Li2,3, Lei Shen2,3, Yongfu Yu4, Hang Li1,2, Deng Cai1,2, Yihua Sun1,2, Haiquan Chen1,2 1Department of Thoracic Surgery, Shanghai Medical College, Fudan University Shanghai Cancer Center, Shanghai, China, 2Department of Oncology, Shanghai Medical College, Fudan University Shanghai Cancer Center, Shanghai, China, 3Department of Pathology, Fudan University Shanghai Cancer Center, Shanghai, China, Immunohistochemistry Immunohistochemistry Immunohistochemistry Immunohistochemistry Immunohistochemistry (IHC) involves the process of selectively imaging antigens (e.g. proteins) in cells of a tissue section by exploiting the principle of antibodies binding specifically to antigens in biological tissues.[1] IHC takes its name from the roots "immuno", in reference to antibodies used in the procedure, and "histo," meaning tissue (compare to immunocytochemistry). Albert Coons conceptualized and first implemented the procedure in 1941.[2] Immunohistochemical staining is widely used in the diagnosis of abnormal cells such as those found in cancerous tumors. Specific molecular markers are characteristic of particular cellular events such as proliferation or cell death (apoptosis).[3] Immunohistochemistry is also widely used in basic research to understand the distribution and localization of biomarkers and differentially expressed proteins in different parts of a biological tissue. Visualising an antibody-antigen interaction can be accomplished in a number of ways. In the most common instance, an antibody is conjugated to an enzyme, such as peroxidase, that can catalyse a colour-producing reaction (see immunoperoxidase staining).[4] Alternatively, the antibody can also be tagged to a fluorophore, such as fluorescein or rhodamine (see immunofluorescence). Digital polymerase chain reaction (digital PCR, DigitalPCR, dPCR, or dePCR) is a biotechnological refinement of conventional polymerase chain reaction methods that can be used to directly quantify and clonally amplify nucleic acids strands including DNA, cDNA or RNA. The key difference between dPCR and traditional PCR lies in the method of measuring nucleic acids amounts, with the former being a more precise method than PCR, though also more prone to error in the hands of inexperienced users.[1]:217 A “digital” measurement quantitatively and discretely measures a certain variable, whereas an “analog” measurement extrapolates certain measurements based on measured patterns. PCR carries out one reaction per single sample. dPCR also carries out a single reaction within a sample, however the sample is separated into a large number of partitions and the reaction is carried out in each partition individually. This separation allows a more reliable collection and sensitive measurement of nucleic acid amounts. The method has been demonstrated as useful for studying variations in gene sequences — such as copy number variants and point mutations — and it is routinely used for clonal[disambiguation needed] amplification of samples for next-generation sequencing. ihc ihca ihc protocol ihc原理 ihc4 ihc 染色 ihc染色原理 ihc 步驟 ihc staining ihc-p ihc protocol ihc stain ihc 染色 ihc 步驟 ihc staining ihc 中文 ihc world ihc score ihc twc ihc blocking ddpcr ddpcr原理 ddpcr supermix ddpcr bio rad ddpcr protocol ddpcr ngs ddpcr multiplex ddpcr ppt ddpcr supermix for probes (no dutp) ddpcr hiv ddpcr 原理 ddpcr supermix ddpcr bio rad ddpcr protocol ddpcr ngs ddpcr multiplex ddpcr ppt ddpcr supermix for probes (no dutp) ddpcr hiv ddpcr multiplexing ngs ngsff ng sdh ngstyle ngse ngsl ngs 初始化錯誤 ngsp ngspice ng switch ngs 原理 ngs 初始化錯誤 ngs hacking detected ngs illumina ngs airport ngs data analysis ngs data ngs wiki ngs 分析 ngs 應用 general genesis generic general 中文 generation geneva generous 中文 generator generous generate gene 中文 gene ontology gene therapy gene kelly gene simmons gene expression gene hackman gene card gene expression 中文 gene wilder krasnodar kras krasnoyarsk kras mutation kras巧克力 krasnoyarsk 中文 krashen kraso kras基因 krasny krym kras mutation kras 巧克力 kras 基因 kras wild type kras g12d kras mutation中文 kras nras kras lung cancer kras chocolate kras pathway egfr egfr calculator egfr計算 egfr mutation egfr 中文 egfr公式 egfr是什麼 egfr過低 egfr檢驗值 gfr正常值 egfr calculator egfr mutation egfr 中文 egfr 公式 egfr 計算 egfr tki egfr 肺癌 egfr inhibitor egfr cancer gfr 正常值 p53 p53 pathway p530 p53 apoptosis p53 p21 p53 mdm2 p53 mutation p53 antibody p53 cancer p53 protein p53 gene p53 pathway p53 apoptosis p53 p21 p53 mdm2 p53 mutation p53 antibody p53 cancer p53 protein p53 cell cycle 抗體抗體抗原抗體英文抗體結構抗體是什麼抗體藥物抗體力價抗體成分抗體製造抗體篩檢抗體抗原抗體英文抗體成分抗體蛋白質抗體 fc 抗體結構抗體受體抗體日文抗體輕鏈抗體陽性 santa cruz santa cruz 景點 santa cruz bike santa cruz 滑板 santa cruz 台灣 santa cruz nomad santa cruz bolivia santa cruz beach boardwalk santa cruz weather santa cruz skateboard santa cruz 景點 santa cruz biotechnology santa cruz bike santa cruz 滑板 santa cruz 台灣 santa cruz nomad santa cruz beach boardwalk santa cruz bolivia santa cruz weather santa cruz de tenerife cancer cancer 中文 cancer fund cancer research cancer cell cancer 星座 cancer council cancer research impact factor cancer ptt cancer council 防曬 cancer 中文 cancer fund cancer research cancer cell cancer 星座 cancer council cancer research impact factor cancer ptt cancer council 防曬 cancer letters 期刊期刊英文期刊縮寫期刊排名期刊下載期刊查詢期刊排名查詢期刊點數期刊格式期刊投稿期刊英文期刊點數期刊格式期刊論文期刊縮寫期刊 impact factor 期刊查詢期刊下載期刊排名期刊論文差別

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目前分類：基因叔叔講講RAS (19)

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Jan 18 Thu 2018 11:49
貓與犬屬的KRAS基因

在人類癌症中，研究指出，許多癌症的發生都與RAS基因突變有關。

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Dec 21 Thu 2017 15:14
在腸息肉中KRAS和BRAF基因突變對大腸直腸癌的風險評估影響

腸息肉的高危險特徵是基於大小、數量和病理特徵做判斷!!

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Dec 07 Thu 2017 15:44
帶有KRAS基因突變且第III期或高風險第II期大腸直腸癌患者服用FOLFOX治療的癒後較差

隨著生活及飲食方式之西方化

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Nov 23 Thu 2017 17:12
癌思停注射劑 (Avastin®, Bevacizumab)治療KRAS基因G12V和G12A突變的轉移性大腸直腸癌患者的癒後較差

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Nov 02 Thu 2017 10:09
大腸直腸癌在常規診斷常出現的KRAS突變的頻率

早期腺癌至晚期腺癌的過程中，KRAS 致癌基因 (Oncogene)突變是促進這個時期發展的主要關鍵角色。

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Oct 12 Thu 2017 16:13
糞便檢體中K-ras密碼子12突變與結腸直腸癌患者年齡的相關性

大腸直腸癌是世界上主要的腫瘤之一，死亡率在世界癌症死亡排名第三

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May 17 Wed 2017 05:38
RAS突變在黑色素瘤中的角色

圖片2-1.tif

黑色素瘤 (Melanoma)的發生率，在美國排名第六名 (圖一)。在台灣，根據102年的十大癌症排名，歸類於第8名的皮膚癌當中 (圖二)。

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May 05 Fri 2017 11:37
非小細胞肺癌 (Non-small cell lung cancer)中的KRAS突變

1. Lung cancer.tif

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Mar 30 Thu 2017 16:47
角色扮演遊戲—RAS參與的訊息傳遞路徑

圖片1.tif

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Feb 24 Fri 2017 09:23
期刊導讀：當KRAS突變了，公斑馬魚比母魚更快得到肝癌？

HCC-hormone-1.tif

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Dec 22 Thu 2016 11:22
期刊導讀：維他命C可以選擇性地殺死KRAS及BRAF突變的大腸直腸癌細胞？

Journal：Science

IF：34.661

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Nov 10 Thu 2016 12:58
期刊導讀：肥胖影響胰臟癌的產生，與KRAS有什麼關係？

Obesity, Pancreatic cancer, KRAS.png

造成胰臟癌的危險因子 (Risk factor)有很多，其中與飲食習慣較相關者包含：抽菸、過量飲酒、咖啡、糖尿病、肥胖等。

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Nov 03 Thu 2016 09:53
期刊導讀：RAS如何影響血管新生而幫助腫瘤生長呢？

血管新生 (Angiogenesis)是人體生長、發育、組織器官形成過程中常見的一個重要過程，同時也會影響組織病變及各種疾病，例如：傷口癒合、腦中風、心血管疾病、糖尿病等，同時更參與了腫瘤生長和轉移。

當腫瘤細胞生長時缺乏血液中營養物質供應，腫瘤只能生長至約1-2 mm³之體積大小，最後細胞會進入Apoptosis或Necrosis的細胞死亡過程，一旦血管新生後有充足養分，腫瘤便會擴大生長範圍。

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Oct 27 Thu 2016 09:44
期刊導讀：RAS如何走向細胞存活而引發癌症？

RAS在細胞中一般都扮演什麼樣的角色呢？正常情況下，RAS活化後可以藉由下游路徑的開啟，進而影響細胞產生各種生理功能，例如：細胞生長 (Cell growth)、細胞增生 (Cell proliferation)、存活 (Survival)、分化 (Differentiation)、侵襲 (Invasion)、細胞凋亡 (Apoptosis)等^[1] (圖一)。

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Oct 21 Fri 2016 15:48
致癌基因界的殺手家族：RAS基因家族與癌症的關係

RAS家族

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Oct 21 Fri 2016 05:54
期刊導讀：百變的RAS--RAS蛋白具有多變性的原因

來自三個RAS基因產生的四種不同的RAS蛋白(NRAS、HRAS、KRAS4A、KRAS4B)具有高度相同的特性，包含：(1) 約有82-90%的胺基酸序列是相同的， (2) 蛋白質摺疊結構， (3) 生物化學功能特性。RAS蛋白N端 (末端)164個胺基酸的序列構成G domain，G domain主要與GDP或GTP結合的位置，其中包含了兩個區域—SwitchⅠ (SⅠ)和SwitchⅡ (SⅡ)，調控GDP及GTP結合，以及構型的改變，因此這個位置的胺基酸序列是高度相同的。然而，RAS蛋白的C端為變異度較高的區段，胺基酸序列相似度較低，這個變異度高的地方就是影響不同的RAS蛋白修飾及會產生不同功能之處，此區段稱為C-terminal hypervariable region (HVR)。

近年來陸續有研究發現，四種RAS蛋白的不同主要是因為在HVR位置上蛋白轉譯後修飾的差異，以下介紹幾種RAS蛋白的轉譯後修飾：

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Oct 07 Fri 2016 15:30
RAS簡介-3 —Cancer-specific hotspot

RAS 蛋白的氨基酸序列中有許多容易造成突變的位點，這些突變位點的變異性也是造成RAS蛋白表達異常及功能上可能產生Gain-of-function的主要原因之一，其中，又有三個位置是最常見的突變位點 (Hotspot)—G12、G13、Q61，可能產生的突變包含：G12V、G12R、G13D、Q61L等^[1] (圖一)。

圖一、胺基酸縮寫整理表^[1]

KRAS mutation frequency中，有83%為G12 mutation，G13 mutation為11%，Q61 mutation則比例較低，僅2%。而在NRAS mutation frequency則是以Q61為最常見，其次為G12及G13；HRAS mutation frequency則是三者比例差不多。此外，這些不同位點的突變可能形成的癌症類型也很不同，例如：人類皮膚黑色素瘤 (Melanoma)中RAS mutation主要來自於NRAS Q61 mutation，而NRAS G12 mutation則較少；相反地，急性骨髓性白血病 (Acute myeloid leukemia)則主要由於NRAS G12 mutation；而胰腺導管腺癌 (Pancreatic ductal adenocarcinoma; PDAC)中RAS muation則主要為KRAS G12 mutation，G13及Q61則較少，大腸直腸癌 (Colorectal adenocarcinoma; CRC)則主要為KRAS G13 mutation。

由下圖舉例說明，KRAS中G12和G13 mutation在不同類型的癌症中之突變率差異，隨著Cancer type而有很大的不同，有些類型的癌症發生原因中，由KRAS所造成的突變點幾乎都來自於同一種突變位點所造成^[3]。

圖二、KRAS hotspot mutation

這些結果顯示，RAS不同位點具有不同的功能，而且這幾個Hotspot都是容易致癌的位點，並隨著所在之組織或器官而有所區別^[1]。

Reference：

1.G. Aaron Hobbs, Channing J. Der, et al. RAS isoforms and mutations in cancer at a glance. Journal of Cell Sci. 2016; 129:1287-1292.

2.http://wlhunag.blogspot.tw/2012/06/blog-post.html

3. Cyriac Kandoth, Michael D. McLellan, Fabio Vandin, et al. Nature. 2013; 502:333-339.

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Oct 07 Fri 2016 15:01
RAS簡介-2 —尋找有效治療RAS mutation的方法

致力於RAS致癌基因的相關研究已持續進行了30多年，許多研究團隊研發直接或間接抑制RAS表達的Antagonist，但在臨床上仍然沒有一個能有效治療RAS mutation的方式，主要有兩個原因，第一，RAS蛋白家族中四種主要蛋白質的功能各異，且具多變性；第二，RAS基因序列可能產生的Missense mutation有大於130種的可能性，因此致力於RAS基因序列上Mutation-specific consequence仍為重要的努力方向^[1]。

而近年來，研究中發現某些小分子可以透過不同的方式，結合於RAS蛋白上或訊息傳遞路徑中其他蛋白，進而抑制RAS所產生的功能，以下列出幾種抑制RAS活化的方式作說明：

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