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聚合酶連鎖反應(PCR)幾乎是分子生物學中最普遍的技術,PCR主要是三個循環步驟,包括了DNA變性黏合以及延長,擴增特定序列的DNA片段。接著陸續發展出許多以PCR為基礎,廣泛用於人類的疾病及其他動植物病蟲害等的檢測儀器,其中較常見的有:即時聚合酶連鎖反應(Real-time PCR)、聚合酶連鎖反應-限制性片段長度多態性(PCR-RFLP)、聚合酶連鎖反應(Nested PCR)及多重聚合酶連鎖反應(Multiplex PCR)等。而其中又以Real-time PCR被使用最多,除了縮短反應時間外,隨著技術的更新,更能達到高效率、準確及靈敏度等優點[1]

    Real-time PCR又稱Quantitative real time polymerase chain reaction (簡稱RT-PCRqPCR),其概念為在DNA擴增反應中,加入特定螢光染劑,推算聚合酶連鎖反應(PCR)後的產物總量[2]

    依其標定螢光物又分成非專一性化學標定(SYBR Green )與專一性化學標定(TaqMan probe)[3]

第一種為非專一性化學標定(SYBR Green I ):

    SYBR Green I 螢光染劑會與雙股DNA的minor groove結合,崁入DNA中,因此PCR的過程中,在每個循環結束時偵測螢光強弱,就能推算出有多少PCR的產物,但因為是非專一性的結合,所以SYBR Green I除了結合到目標產物上,同時也會結合到其他的DNA中,因此這可說是SYBR Green I 的缺點之一[3]

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圖一、SYBR Green I偵測系統

第二種為TaqMan probe (hydrolysis probe)

    透過人工合成的TaqMan probe (oligonucleotid),在oligonucleotid兩端分別標定上不同螢光物質,而這兩螢光物質彼此間距離太近時會遮蔽掉彼此的螢光,因此無法偵測到螢光,但是當DNA進行複製時,oligonucleotid會被切割水解,讓兩個螢光物質分開,因此能偵測到螢光,螢光越強代表PCR產物越多。其中使用的probe是特異性與Taq結合,因此不會偵測到非特異性的反應,這也是TaqMan probe的優點[3]

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圖二、TaqMan probe偵測系統

    而另一種PCR,逆轉錄PCR (reverse transcription-PCR)也簡稱為RT-PCR,是聚合酶鏈式反應(PCR)的一種應用,主要用於RNA的複製。在RT-PCR過程中,RNA先被逆轉錄成爲互補的DNA (cDNA),再以此爲模板透進行PCR反應,大量複製DNA。

   RT-PCR在臨床上可應用於基因診斷、傳染病檢測、病毒分型、微生物檢測以及SNP的檢測等,應用範圍很廣,隨著科技的日新月異,RT-PCR相關儀器將會發展更多元,讓靈敏度、準確率以及成本都達到最佳化,造福更多的社會大眾。

 

參考資料

Edited by A-Kai

  1. http://www.bio-protech.com.tw/databank/DataSheet/Machine/Real-time%20PCR%E6%A6%82%E8%AB%96.pdf
  2. https://zh.wikipedia.org/wiki/%E5%8D%B3%E6%99%82%E8%81%9A%E5%90%88%E9%85%B6%E9%8F%88%E5%BC%8F%E5%8F%8D%E6%87%89
  3. http://yourgene.pixnet.net/blog/post/88168005-q-pcr%28real-time-pcr%29
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