DNMT全名 DNA methyltransferases
有3種亞型:DNMT1、DNMT2、DNMT3
其中,DNMT3又分為DNMT3A1、DNMT3A2、DNMT3B及DNMT3L
各種亞型除了序列不同之外,負責的作用也不同。
而DNMT3A基因突變,常見於早期的血癌!!
依照不同的DNMT3A基因突變並合併其他基因變異~~
會各自發展成不同的血癌類型。
圖A. DNMT3亞型的胺基酸序列
基因知識補給站
在這裡需要帶入等位基因概念,來了解不同基因突變的分類,所發展的血癌類型~
如圖B,按照編號依序介紹!!
- 兩條染色體,其中1條染色發生DNMT3A基因突變
1-1. DNMT3A合併FLT3、NPM1及IDH1基因突變會發展成AML
1-2. DNMT3A合併SF3B1及U2AF1基因突變會發展成MDS
1-3. DNMT3A合併IDH1及IDH2基因突變會發展成MPN
1-4. DNMT3A合併TET2、RHOA及IDH2基因突變會發展成PTCL
圖B. DNMT3A突變-血癌類型
因此,DNMT3A在初期的血癌可以作為一個重要的基因突變標的!!
DNMT3A常會出現哪些基因突變呢?
如下圖C,可以發現DNMT3A在途中紫色的部分,是最常發生突變的位置!!
另外,也可以發現有不同基因突變的類型,引發紫色這段區域產生基因變異。
圖C. DNMT3A常發生基因突變的位置
接著,來統計一下DNMT3A在各式各樣基因突變產生的發生率,如圖D
統計結果發現,在AML患者中,
- 約有58%R882X基因突變
- 約有2%R736X 基因突變
圖D. DNMT3A基因突變機率
DNMT3A在臨床上是否能作為癒後評估得指標?
(1)
首先根據一篇文獻指出,約有22%的AML患者有DNMT3A基因突變的情形!!
其中,約有60%的DNMT3A基因突變發生在R882X的位置!!
(2)
評估與DNMT3A基因突變對患者癒後存活率的分析!!
如圖E,比較DNMT3A基因突變與否對存活率的影響
野生型DNMT3A,存活率最高最長
突變DNMT3A,存活率明顯下降
圖E. DNMT3A基因突變存活率
(3)
比較DNMT3A基因突變合併FLT3基因突變後,對存活率的影響,如圖F
結果還是~~
野生型DNMT3A,存活率最高最長
突變DNMT3A,存活率明顯下降
但跟圖E比較的話~
可以發現單純DNMT3A基因突變,存活時間約為75個月左右
若DNMT3A基因突變合併FLT3基因突變的患者存活時間約只有60個月左右!! 存活時間更短
圖F. DNMT3A基因突變合併FLT3基因突變存活率
(4)
因AML常發生於年齡> 65歲的老年人,所以,再接著評估年齡與DNMT3A基因突變對存活率的影響!! 如圖G
野生型DNMT3A,存活率最高最長
突變DNMT3A,存活率明顯下降
若年齡< 60歲,存活率相對於年齡>60歲的高!!
若年齡> 60歲,存活率則有顯著的下降
圖G. DNMT3A基因突變與年齡對患者存活率的影響
因此~~
DNMT3A可以做為評估AML患者癒後的標的!!
若患者同時合併其他基因突變或年紀較長,都會使患者的存活率急速下降!!
參考資料:
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